2016年4月14日 星期四

Crambin

Crambin是種儲存用蛋白質,儲存在Abyssinian cabbage的種子裡面。Crambin很小,只有46個殘基。由於crambin的結晶很特別,使用X射線晶體學可以得到很非常高解析度(resolution)的立體結構。

下面的結構來自於蛋白質結構資料庫PDB,分別是
  • 1crn,長度是46個殘基,解析度是1.5 Å,1981年就上傳到PDB
  • 3u7t,長度是48個殘基,解析度則是0.85 Å,2012年上傳到PDB 
Two crambin molecules
兩者用PyMOL的CE alignment後,相似度用RMSD計算是0.83 Å,非常的像

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